Septembra vidējā gaisa temperatūra šogad Latvijā bija +11,9ºC, kas ir tuvu ilggadējai normai (0,2 °C virs tās), tādējādi ierindojoties rudens pirmo mēnešu ilggadējās datu rindas vidusdaļā. Starp 21. gadsimta rudens pirmajiem mēnešiem šī gada septembris ir trešais vēsākais pēc 2008. (+10,9ºC) un 2010. (+11,5ºC) gadiem. Savukārt vissiltākais 21. gadsimtā un trešais siltākais ilggadējā datu rindā ir bijis 2006. gada septembris, tā vidējā gaisa temperatūra bija +14,2ºC.
Ar mēneša vidējo nokrišņu daudzumu kopumā Latvijā 87 mm (122% no ilggadējās normas) šī gada septembris mēneša nokrišņu daudzuma ilggadējo datu rindā ir ierindojies mitrāko rudens pirmo mēnešu trešajā desmitā. 21. gadsimta septembru skaitā 2013. gada septembris ir otrais mitrākais pēc 2010. gada, kurā septembra nokrišņu daudzums bija 95 mm. Savukārt vissausākais 21. gadsimtā un trešais sausākais ilggadējā datu rindā ir bijis 2003. gada septembris, tā nokrišņu daudzums bija 27 mm.
Pēc lietainajām šī gada septembra pirmajām dienām anticiklona ietekmē Latvijā iestājās sauss un silts laiks. Teritorijas lielākajā daļā dienā gaiss sasila līdz +18…+23 °C, mēnesī visaugstāko temperatūru sasniedzot 8. septembrī Saldū: +25,4ºC. Par rudeni šai laika posmā liecināja vien dzestrās naktis, kurās temperatūra noslīdēja lielākoties līdz +6…+11 °C, vietām arī vēl zemāk. Naktī uz 7. septembri Zosēnos tika reģistrēta šoruden pirmā salna gaisā – līdz –0,4 °C.
Mēneša otrajā pusē, Latvijai atkal nonākot ciklonu ietekmē, atjaunojās nokrišņi un temperatūra slīdēja lejup. Viszemākās vērtības tā sasniedza mēneša beigu daļā, kad ar ziemeļu vējiem Latvijā ieplūda pavisam vēss gaiss. No 25. septembra līdz pat mēneša beigām sals gaisā bija katru nakti, 26. septembrī Ainažos tika reģistrēta šomēnes viszemākā gaisa temperatūra: –3,2ºC.
Nokrišņi mēneša otrajā pusē bija katru dienu. Vislielākais diennaktī nokrišņu daudzums tika reģistrēts 23. septembrī Ogres novada Lielpēčos– 68% no visa mēneša normas. Ar mēreniem un brīžam arī stipriem nokrišņiem vairākās perioda dienās vislielākais 2013. gada septembrī Latvijā mēneša nokrišņu daudzums (130 mm, kas 2,3 reizes pārsniedz normu) bija Dobelē. Tik daudz nokrišņu septembrī Dobelē tika reģistrēts pirmoreiz. Vismazāk septembra nokrišņu zonas skāra Vidzemes centrālos un austrumu rajonus – Alūksnē un Lubānā mēneša nokrišņu daudzums nebija pat puse no normas. 25. un 26. septembrī tika novēroti šoruden pirmie nokrišņi ledus graudu veidā, bet 30. septembrī Lielpēčos pirmo reizi šoruden īslaicīgi sniga slapjš sniegs.
Mēneša vidējais vēja ātrums (2,2 m/s, kas ir 0,9 m/s zem normas) bija otrais lēnākais pēdējos 37 gados novērotais. Stiprākās vēja brāzmas bija 2. septembrī, piekrastes rajonos sasniedzot 18–22 m/s, un 23. septembrī, kad Kurzemē un Latvijas centrālajos rajonos tās sasniedza 20 m/s, bet Baltijas jūras un Rīgas līča piekrastē 20 – 23 m/s.